Fix warnings for bundled muParser

Fix warnings for bundled boost

Merge pull request #5855 from masterleinad/replace_last_boundary_occurence

Replace last Boundary occurences in the test folder

Merge pull request #5805 from dangars/gmsh-test

Add Transfinite Line

Merge pull request #5853 from drwells/unused-scalapack

deal with unused variable warnings in scalapack bindings and bundled code.

Remove tria_boundary.h and replace Boundary<2>::FaceVertexNormals

Merge pull request #5852 from drwells/remove-cylindermanifold-specialization

Remove the hidden CylindricalManifold<dim, 3> code.

Suppress warnings in bundled packages.

comment out unused variables in scalapack bindings.

Replace the last Boundary object in the tests

Remove the hidden CylindricalManifold<dim, 3> code.

It turns out that we have converted enough compile-time dimensionality checks to
run-time dimensionality checks that we can use just one implementation for
CylindricalManifold instead of two.

Merge pull request #5846 from bangerth/step-dependencies

List for each tutorial what others it depends on.

Merge pull request #5845 from bangerth/doc-update

Update documentation around hyper-balls and spherical manifolds.

Merge pull request #5834 from masterleinad/fullmatrix_size_type

FullMatrix size type

Merge pull request #5850 from masterleinad/fix_scalapack_10

Fix scalapack_10

Fix scalapack_10

Changelog entry

Update test output

static_cast in full_matrix.templates.h

static_cast in lapack_full_matrix.h

Replace n_rows() by m(), n_cols() by n() in lapack_full_matrix.cc

Change size_type for LAPACKFullMatrix

Change size_type for FullMatrix

Use size_type in table.h for index access

Use std::size_t in table_indices.h for index access

Remove const_cast in lapack_full_matrix.cc

Use the type of the largest value in AssertIndexRange

List for each tutorial what others it depends on.

Update documentation around hyper-balls and spherical manifolds.

In particular, link to the discussion in the results section of step-6.

Merge pull request #5842 from jppelteret/add_dim_0_tensor_assignment_operator

Add operator assigning a scalar to a Tensor<0>.

Merge pull request #5843 from masterleinad/unused_dof_handler

Fix unused variables in dof_handler.cc

Fix unused variables in dof_handler.cc

Change the default value of a parameter from 0 to nullptr.

Facilitate casting between tensors of AD numbers to floats.

Add operator assigning a scalar to a Tensor<0>.

Merge pull request #5781 from BenBrands/scalapack

ScaLAPACKMatrix: add routines to save/load matrix to/from disc

Merge pull request #5841 from jppelteret/fix_5840

Remove a typedef thats unused when compiling in release mode.

Add Transfinite Line

Remove a typedef thats unused when compiling in release mode.

Fixes 5840.

Merge pull request #5827 from bangerth/sort-code-gallery

Sort entries to the code gallery by their name, not their directory name.

Merge pull request #5837 from QiaoLei-88/fix_icc15_compile

make icc 15 compiles on CentOS 7

Merge pull request #5836 from bangerth/fix-wording

Use less obscure wording.

Use less obscure wording.

Merge pull request #5838 from kronbichler/mf_dg_step1

Add macro for __restrict keyword.

Add macro for __restrict keyword.

Merge pull request #5831 from masterleinad/fix_periodicity_01

Fix mpi/periodicity_01

Merge pull request #5835 from Rombur/trilinos_documentation

Remove reference to a function that does not exist

satisfy icc 15 about template arguments of std::map's

Remove reference to a function that does not exist

Merge pull request #5833 from masterleinad/fix_enriched_ice

Fix ICC-16 ICE in fe_enriched.h

Workaround ICC compiler bug

Merge pull request #5832 from masterleinad/fix_typo_finitelement

Fix typo FinitElement

Fix typo FinitElement

Merge pull request #5826 from Rombur/cusparse_assert

Cusparse assert

Merge pull request #5714 from masterleinad/replace_hypersphere

 Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Add changelog entry

Add AssertCusparse macro to check that a cuSPARSE routine was successful

Improve documentation

Clean up

Replace HyperShellBoundary by SphericalManifold in tests

Fix else branch in SphericalManifold::normals_at_vertices

Fix mpi/periodicity_01

Merge pull request #5830 from kronbichler/fix_mg_transfer_mf

Fix matrix-free transfer for multi-components FE and p>10

Add changelog.

Add test.

Fix transfer for high polynomial degrees.

Merge pull request #5819 from drwells/project-to-object-tol

Improve tolerances for errors near zero.

Merge pull request #5711 from masterleinad/simplify_normal_spherical

Simplify implementation for normal_vector and get_normals_at_vertices in SphericalManifold

Sort entries to the code gallery by their name, not their directory name.

separated tests for copying sub-matrices

Merge pull request #5825 from Rombur/fix_cuda

Fix a bug in a CUDA vector constructor

Simplify implementation for normal_vector and get_normals_at_vertices in SphericalManifold

corrections_I

improve documentation and minor clean-ups

add routine copy_to to copy content of a submatrix of A to a submatrix of B

add tests for save/load of ScaLapackMatrix

add routines to save/load ScaLAPACK matrices using HDF5

add hdf5_type_id to return HDF5 type

Merge pull request #5823 from BenBrands/move_some_to_some

move implementation of Utilities::MPI::some_to_some()

Fix a bug in a CUDA vector constructor

The constructor did not set the values in the vector to zero

Merge pull request #5824 from masterleinad/rm_sd_ids_p_08

Remove subdomain_ids_parallel_08

Merge pull request #5779 from masterleinad/fix_periodic_dofs

Fix periodicity constraints for multiply constrained DoFs

Merge pull request #5811 from bangerth/unpack-for-arrays

Add a variant of Utilities::unpack() for arrays.

Remove subdomain_ids_parallel_08

move implemetation of MPI::some_to_some

Merge pull request #5822 from bangerth/copyright

Update copyright years.

Merge pull request #5820 from BenBrands/move_all_gather

Move implementation of MPI::all_gather()

Update copyright years.

Merge pull request #5817 from drwells/cppcheck-4

Fix some things cppcheck found.

Merge pull request #5821 from masterleinad/fix_utilities_pack_unpack_03

Fix utilities_pack_unpack_03

Merge pull request #5809 from bangerth/pointers

Specialize ArrayViewHelper::is_contiguous() for pointers.

Fix utilities_pack_unpack_03

Use nullptr for the null pointer.

Use constant references instead of copies.

This was found by cppcheck.

Reduce the scope of some variables.

This was found by cppcheck.

Fix initialization of protected/private solver members.

This was found by cppcheck.

Move implementation of MPI::all_gather()

Improve tolerances for errors near zero.

Details in the floating point implementation (e.g., whether or not -ffast-math
is used) can change the error by an order of magnitude or more. Get around this
by, in each relevant case, bounding the error above.

Since the errors are now checked in a different way the alternative output file
has been removed.

Merge pull request #5816 from jppelteret/fix_5763

Ensure parallel::Tria can't be used with DoFRenumbering::subdomain_wise

Merge pull request #5784 from BenBrands/utilities_mpi_gather

Add Utilities::MPI::gather