improve TrilinosWrappers::PreconditionILU documentation

document SparsityPattern::bandwidth

Merge pull request #520 from Rombur/threads_init

Add set_thread_limit in step-9.

Add set_thread_limit in step-9.

Merge pull request #580 from bangerth/step-7-update

Update the documentation of step-7.

In particular, name the Method of Manufactured Solutions in the documentation.

Update the documentation of step-7.

In particular, name the Method of Manufactured Solutions in the documentation.

Merge pull request #575 from kronbichler/master

Improve documentation of VectorMemory in Solver

Merge pull request #578 from tamiko/fix_bundled_umfpack

CMake: Bugfix: Also install bundled Umfpack headers

CMake: Bugfix: Also install bundled Umfpack headers

With "sparse_direct.h" directly including "umfpack.h" we also have to make
sure to install the bundled header files...

Merge pull request #577 from tjhei/mpi_file_fixes

fix status parameter in MPI_File_write

fix status parameter in MPI_File_write

Reported by Thomas Geenen. Setting the MPI_Status* parameter to NULL is
not correct and fails with intel MPI. The correct argument to pass is
MPI_STATUS_IGNORE.

Improve documentation

Merge pull request #574 from bangerth/doc-update-7

Improve error messages.

Improve error messages.

Using bare exceptions without any explanatory text in so many places was a bad idea right from the beginning, though nobody seems to have noticed for a long time. This replaces a bare exception with an ExcMessage in a couple of places.

Merge pull request #572 from kronbichler/cleanup_mapping

Remove a few 1D specializations for mapping.

Remove a few 1D specializations for mapping.

The old implementation of MappingQEulerian only moved the vertices
in 1D, not interior points for higher order mappings. While it might
be debatable how useful non-linear mappings are in 1D, this was not
documented and lead to surprising behavior. By making the class more
general we can actually make our code base simpler because we can remove
a few template specialization and use the same code as in higher
dimensions.

Merge pull request #566 from kronbichler/fix_vector_memory

Put implementation (Growing)VectorMemory into .templates.h file

Merge pull request #571 from kronbichler/tensor_vs_point_fix

More Point vs Tensor fixes

More Point vs Tensor fixes

Put implementation (Growing)VectorMemory into .templates.h file

This enables users to provide instantiations of the class for non-deal.II
vector types and their use in Solver classes.

Reported by Karl Ljungkvist.

Merge pull request #568 from bangerth/further-tensor-fixes

More Point vs Tensor fixes.

Merge pull request #567 from tamiko/export_umfpack_include_dir

CMake: Bugfix: Also export suitesparse include directories in project config

More Point vs Tensor fixes.

CMake: Bugfix: Also export suitesparse include directories in project config

With 053bb82 a direct include of "umfpack.h" was introduced in
"sparse_direct.h" which makes it necessary for the user to have the umfpack
include directory location available

Closes #564

Merge pull request #565 from bangerth/more-tensor-fixes

More changes hoping to make the compiler happy with OpenCascade interfaces again

More changes hoping to make the compiler happy with OpenCascade interfaces again.

Merge pull request #562 from bangerth/tensor-fixes

Tensor fixes

Further fixes to accommodate new Point vs Tensor distinction.

Merge pull request #563 from bangerth/doc-updates-5

Doc updates for build_patches().

Doc updates for build_patches().

Remove a partial specialization that creates trouble due to ambiguity
and that looks wrong anyway.

Hopefully fix a few build regressions with opencascade (can't test here
since no opencascade installation locally available).

Merge pull request #560 from tjhei/multithread_deprecation

more multithread_info fixes

- initialize static members correctly when THREADS=OFF
- update documentation
- do not use deprecated multithread_info instance
- use n_cores() instead of n_cpus

fix multithread_info when THREADS=OFF

static members have to be initialized even if deal.II is configured
without multithreading.

more multithread_info deprecation fixes

Merge pull request #559 from guidokanschat/fix_multithreading_issues

Fix issues with multithreading off and remove deprecated usage

Fix issues with multithreading off

Merge pull request #558 from bangerth/update-product-type

Provide specializations for ProductType<T,T>. Add a test.

Provide specializations for ProductType<T,T>. Add a test.

Merge pull request #555 from bangerth/doc-fixes-12

Fix a number of doxygen issues.

Merge pull request #556 from bangerth/remove-deprecated-functions-13

Remove deprecated functions from SparseMIC and SparseLUDecomposition

Merge pull request #552 from bangerth/update-point

Rename template args of Point and Tensor

Update documentation in Point and Tensor.

In particular, document the intent of the various template arguments.

Remove deprecated functions from SparseLUDecomposition.

We can't have two @ingroup statements for one function, apparently.

Turns out that we cannot have @brief or @file commands used in a way that would document the current file. Make it a regular comment instead.

Refer to the proper parameter.

Wrap text where appropriate.

Reference a member the proper way.

Avoid referencing things doxygen doesn't know about.

Avoid a template argument to make doxygen happy.

Use only one of @file and @brief to make doxygen happy.

Fix up a dollar sign that otherwise trips up doxygen.

Remove deprecated function SparseMIC::reinit().

Merge pull request #550 from bangerth/doc-update-6

Minor doc update.

Minor doc update.

Merge pull request #549 from bangerth/update-info-for-set_thread_limit

Update a few comments that relate to set_thread_limit().

Update a few comments that relate to set_thread_limit().

Merge pull request #547 from bangerth/add-changelog-entry-2

Add a changelog entry for a patch from yesterday.

Add an entry for a recent patch.

Merge pull request #528 from bangerth/remove-deprecated-11

Remove deprecated functions SparsityPattern::get_rowstart_indices and SparsityPattern::get_column_numbers.

Merge pull request #543 from bangerth/add-test-3

Add a test for int*Tensor<1, double>

Merge pull request #524 from tjhei/multithreadinfo_instance

Do not allow instantiation of MultithreadInfo

Remove deprecated functions SparsityPattern::get_rowstart_indices and SparsityPattern::get_column_numbers.

These functions have also been deprecated for more than a decade as they leak the storage format of SparsityPattern to the outside.

Rename to follow usual naming conventions.

Add another test only for symmetric tensors.

Add a test.

Merge pull request #548 from bangerth/fix-typo-2

Fix a wrong reference: it should be super-, not semiconductors.

Fix a wrong reference: it should be super-, not semiconductors.

This was pointed out to me by Wei Zhao by email.

Merge pull request #546 from QiaoLei-88/fix-step-33-energy-term

Fix bug in energy source term according to Praveen C's report.

Fix bug in energy source term according to Praveen C's report.

    The energy source term due to gravity should be rho*g*v=g*momentum.

changelog

update tests

avoid using multithread_info

rework MultithreadInfo to have static members only

Merge pull request #544 from bangerth/use-product-type-in-symmetric-tensor

Implement the operator* for mixed types also for SymmetricTensor.

Implement the operator* for mixed types also for SymmetricTensor.

Merge pull request #533 from l-korous/temp1

Small syntax fix for MSVC.

Merge pull request #531 from bangerth/no-expicit-cast-to-point

Do not allow for implicit casts from Tensor to Point.

Merge pull request #541 from bangerth/fix-Number-usage-in-functions

Fix number usage in functions

Augment documentation.

Merge pull request #538 from l-korous/temp6

Add additional library names for UMFPACK to FindUMFPACK.

Add additional library names for UMFPACK to FindUMFPACK.

Merge pull request #534 from l-korous/temp2

Add proper data types to sparse_direct.

Merge pull request #536 from l-korous/temp4

Add proper CXX flags for MSVC debug.

Remove the 'Number' template argument from Point where it is passed around in 'Function' classes.

Merge pull request #540 from l-korous/temp8

Remove the wrong special case of reldir setup for windows.

Merge pull request #532 from bangerth/improve-error-message-2

Improve error message when no LAPACK is available.

Improve error message when no LAPACK is available.

The old error message was written when we had ./configure checks for
individual LAPACK functions, but this is no longer the case: we get
all of LAPACK, or nothing. Reflect this in the text of the error
message.

Small syntax fix for MSVC.

Add proper data types to sparse_direct.

Add proper CXX flags for MSVC debug.

Remove the wrong special case of reldir setup for windows.

Merge pull request #530 from bangerth/doc-update

Link to another tutorial program. Minor edits.

Do not allow for implicit casts from Tensor to Point.

These are likely invalid uses of class Point and should use Tensor instead.
At the same time, still allow for explicit casts.

Link to another tutorial program. Minor edits.

Merge pull request #529 from bangerth/remove-deprecated-functions-12

Remove ConstraintMatrix::distribute(condensed, uncondensed)

Remove the last function that shrinks linear systems.

Merge pull request #527 from tjhei/condense_documentation

remove documentation of ConstraintMatrix:condense(big, small)

remove documentation of ConstraintMatrix:condense(big, small)