extend VectorTools::project() to take fe_component

Merge pull request #5780 from masterleinad/link_error_geometryinfo0

Avoid link errors in GeometryInfo<0>

Avoid link errors in GeometryInfo<0>

Merge pull request #5777 from masterleinad/changelog_typo

Fix typo in changelog entry

Fix typo in changelog entry

Merge pull request #5776 from bangerth/fix-step-42

step-42: Move a statement to where it belongs.

Move a statement to where it belongs.

Merge pull request #5728 from masterleinad/clang-tidy-new

Be explicit about virtual functions called in con-/destructors

Merge pull request #5775 from Rombur/fix_test

Require metis for a test to run

Merge pull request #5766 from bangerth/doc-update-2

Address what 'sequential' means in the context of DoFHandlers.

Merge pull request #5754 from Rombur/cuda_documentation

Make it clear that our CUDA wrappers only support float and double

Merge pull request #5774 from davydden/bugfix_makeunique

fix make_unique

Require metis for the test to run

fix make_unique

Merge pull request #5761 from drwells/improve-2d-transfinite-guess

Improve 2d transfinite guess

Merge pull request #5734 from BenBrands/extend_scalapack_more

Extend scalapack more

Merge pull request #5772 from drwells/use-std-abs

Use std::abs instead of abs.

Use std::abs instead of abs.

On some compilers (notably GCC 4.8.4, in some configurations) 'abs' refers to
'int abs(int)', and gives the wrong answer for floating point arguments.

Merge pull request #5765 from bangerth/doc-update

Update a comment for PETScWrappers::PreconditionBlockJacobi.

Differentiate between quads in 2D and 3D.

In 3D, we may use eight surrounding points either as the eight vertices
of a hexahedron or as eight surrounding points on the surface of a
hexahedron. This patch adds some logic to tell the two cases apart based
on some angle calculations.

Guard a check with an if statement.

Make the TFI chart point calculation more robust.

If the guess computed by the shortcut is not accurate enough then we
should try to use the affine approximation instead.

Add a test for the 2D TFI change.

Merge pull request #5756 from masterleinad/hdf5_quick

Provide HDF5 quicktest

Provide HDF5 quicktest

Merge pull request #5768 from bangerth/doc-update-4

Update class doc of p::s::Triangulation.

Merge pull request #5767 from bangerth/doc-update-3

Address what 'sequential' means in the context of communicators.

Update class doc of p::s::Triangulation.

Provide a link into the glossary.

Address what 'sequential' means in the context of communicators.

Address what 'sequential' means in the context of DoFHandlers.

Update a comment for PETScWrappers::PreconditionBlockJacobi.

reviewer corrections

Merge pull request #5759 from bangerth/fix

Fix DoFTools::locally_owned_dofs_per_subdomain() for empty processors.

Implement a 2D-specific chart point estimate.

The current algorithm calculates a reasonable guess for the chart point
in 3D. Using this 3D algorithm in 2D results in relatively bad guesses:

for i = 5:
affine approx chart point: 0.5 3.64977e-14
pulled back chart point:   1 0.5
for i = 6:
affine approx chart point: 0.5 0.5
pulled back chart point:   0.5 8.678e-17
for i = 7:
affine approx chart point: 0.5 1
pulled back chart point:   0.5 1

This patch adds a 2D-specific algorithm that simply averages the two
adjacent vertices (e.g., chart point 5 is assumed to be an average of
chart points 1 and 3).

This issue was reported by Juan Carlos Araujo Cabarcas, who found a test
case where the affine guess was sufficiently inaccurate that
TransfiniteInterpolationManifold::pull_back failed to find the right
point. This change fixes that test case.

Merge pull request #5760 from bangerth/add-tests

Add tests for complex-valued add_and_dot()

Merge pull request #5750 from bangerth/fix-cuda-vector

Fix CUDAVector::add_and_dot() for complex-valued vectors.

Merge pull request #5755 from drwells/transfinite-message

 Print out more info when TFI encounters errors.

Add changelog entry.

Add test.

Fix DoFTools::locally_owned_dofs_per_subdomain() for empty processors.

Fix CUDAVector::add_and_dot() for complex-valued vectors.

Mark NumberTraits::conjugate() as DEAL_II_CUDA_HOST_DEV.

Merge pull request #5757 from bangerth/add-static-asserts

Add static_asserts for complex-valued cases.

Merge pull request #5742 from drwells/fe-system-dereference-check

Rearrange a pointer check to satisfy coverity.

Add a test for LinearAlgebra::distributed::Vector::add_and_dot().

Add a test for LinearAlgebra::Vector::add_and_dot().

Add a test for Vector::add_and_dot().

Add small comments.

Merge pull request #5758 from dangars/typo-doc-DataPostprocessorTensor

Typo in the documentation of DataPostprocessorTensor

Typo in the documentation of DataPostprocessorTensor

Add static_asserts for complex-valued cases.

Merge pull request #5748 from masterleinad/inline_geometry_info

Inline GeometryInfo members

 Print out more info when TFI encounters errors.

the upper loop bound, c, cannot be larger than the maximum valid index
into the relevant array: therefore we should use '<=' instead of '<' in
a loop bounded above by c.

Make it clear that our CUDA wrappers only support float and double

Inline GeometryInfo

Merge pull request #5735 from Rombur/cmake_cusparse

Add cuSPARSE support in the build system

Merge pull request #5737 from Rombur/cuda_warning

Fix warnings: do not use Assert in CUDA kernel

Merge pull request #5736 from Rombur/cuh

Change .cuh extension to h

Merge pull request #5740 from masterleinad/internal_alignedvector_const

Make parameters and variables for the internal::AlignedVector classes const

Merge pull request #5749 from bangerth/doc-update

Update documentation of *::Vector::add_and_dot for complex vectors.

Merge pull request #5745 from masterleinad/initialize_constexpr_arrays

Initialize constexpr arrays in GeometryInfo

Wrap comments.

Update documentation of *::Vector::add_and_dot for complex vectors.

Merge pull request #5744 from masterleinad/fix_coverity

Fix issues reported by Coverity

Initialize constexpr arrays in GeometryInfo

Fix issues reported by Coverity

Rearrange a pointer check to satisfy coverity.

Coverity (the static analysis program) raises an issue with the way we
check the result of a dynamic_cast. This commit rearranges things so
that we cannot enter the relevant block unless dynamic_cast succeeds,
regardless of the assertion.

Merge pull request #5743 from bangerth/doc-update

Clarify documentation of (hp::)?DoFHandler::distribute_dofs().

Clarify documentation of (hp::)?DoFHandler::distribute_dofs().

Make parameters and variables for the internal::AlignedVector classes const

Merge pull request #5731 from masterleinad/fix_rt_bubbles_tests

Increase precision in FE_RT_Bubbles tests

Merge pull request #5733 from niveshd/ExtendTestFE_Enriched

Minor change in FE Enriched element

Merge pull request #5738 from bangerth/doc-update

Fix a grammar error.

Fix a grammar error.

Fix warnings: do not use Assert in CUDA kernel

Change .cuh extension to .h

Blacklist header files containing CUDA code from all-headers tests

Header files that contain CUDA codes cannot be passed to the host compiler.
Thus, we blacklist them in all-headers tests.

Increase precision in FE_RT_Bubbles tests and filter small values out

Add cuSPARSE support in the build system

Merge pull request #5690 from tamiko/fix_mpi_check

CMake: remove mpi two-pass search

fix return type of pslange_

added least squares routine and tests

added SVD computation and tests

changed eigenvalue/eigenvector computation

Bug fix in FE_Enriched element. Avoid evaluating quadrature points if no dofs are assigned

Merge pull request #5719 from bangerth/doc-update

Update some comments around renumbering DoFs.

Add comments

Merge pull request #5730 from masterleinad/clang-tidy-new__3

Make some variables const (references)

Merge pull request #5729 from masterleinad/clang-tidy-new_2

Use nullptr instead of 0 or NULL

Make some variables const (references)

Merge pull request #5704 from BenBrands/extend_scalapack

 add template wrappers for ScaLAPACK functions

Be explicit about virtual functions called in constructors and destructors

Use nullptr

Merge pull request #5722 from eldarkh/add-fe-rt-bubbles

New Finite Element RT+Bubbles (PR #4540 part II)

CMake: make the MPI compatibility check less strict

When configuring with CMake 3.10 and providing compiler wrappers,
  CC=mpicc CXX=mpicxx cmake ...
the new FindMPI.cmake library does not export MPI_CXX_LIBRARIES and
MPI_C_LIBRARIES any more. So, make the check less strict.

CMake: Support a FindMPI.cmake of CMake version 3.10 and later

This change should also be backward compatible to older CMake versions.
(Fingers crossed.)

add changes entry

CMake: Disable MPI autodetection

CMake: remove mpi two-pass search

As discussed in https://github.com/dealii/dealii/issues/5510, we must
not assume anything about the internal workings of CMake's FindMPI.cmake
module. In particular, it is not sufficient to set CMAKE_<LANG>_COMPILER
to an MPI-compiler wrapper in order for FindMPI.cmake to actually detect
MPI. So, remove this logic in our FindMPI.cmake module.