Update tests with new output.

Since the default test matrix is rectangular, most FullMatrix tests now
have different output.

Update tests with identical output.

The FullMatrix tests now default to using rectangular matrices, but this
does not make sense for every test. This commit modifies tests so that
they use the old (square) test matrix.

Update tests with truncated output.

Use rectangular matrices in FullMatrix tests.

This catches more bugs.

Fix some assertions in FullMatrix.

Fix some (rectangular) FullMatrix methods.

Merge pull request #6023 from bangerth/parallelize

Parallelize FETools::compute_projection_matrices()

Merge pull request #6044 from luca-heltai/coupling-distributed

Distributed coupling.

Updated documentation for parallel triangulations.

Added distributed test.

Merge pull request #6043 from Rombur/xsdk

Do not use macros in the cuda matrix-free

Merge pull request #6042 from MFraters/add_change_entry_for_json_parser_for_input_files

add change entry for the add_json_parser_for_input_files pull request.

Do not use macros in the cuda matrix-free

add change entry for the add_json_parser_for_input_files pull request.

Merge pull request #6040 from bangerth/doc-update-3

Improve readability of doxygen-generated pages.

Merge pull request #6031 from bangerth/update-step-14

Don't use SynchronousIterator in step-9, 14

Merge pull request #6036 from luzpaz/misc-typos

Misc. typos

Merge pull request #6028 from kronbichler/improve_hermite_poly

Make Hermite-like polynomials represent constant by (1,1,...1)

Distributed coupling now working.

Merge pull request #5999 from luca-heltai/coupling

Non-matching sparsity and mass matrix.

Change weight in Hermite-like polynomials to make constant represented by (1,1,1,...1).

Source typos

Found more typos

Revision

Misc. typos

Found via `codespell`

Merge pull request #6032 from bangerth/doc-comm-world

Document the use of MPI_COMM_WORLD in MPI_InitFinalize.

Merge pull request #6041 from masterleinad/allow_valgrind

Add missing file used in #6035

Merge pull request #6038 from bangerth/doc-update-2

Fix doxygen markup.

Merge pull request #6033 from bangerth/doc-update

Document why using MPI_COMM_WORLD is ok in one place.

Merge pull request #5993 from MFraters/add_json_parser_for_input_files

Add json parser for input files

Add missing file used in #6035

Merge pull request #6035 from masterleinad/allow_valgrind

Allow to run the testsuite with valgrind

Fix a couple of places in the documentation of a function.

Improve readability of doxygen-generated pages.

Fix doxygen markup.

Document why using MPI_COMM_WORLD is ok in one place.

Merge pull request #6025 from masterleinad/fix_clang_6_performance

Fix llvm-6 clang-tidy performance findings

Allow to run the testsuite with valgrind

Merge pull request #6034 from bangerth/add-test

Add a test that works on only a subset of MPI processes.

Merge pull request #5998 from bangerth/update-example-output

Update a couple of things on how we generate output in the example steps

Merge pull request #6022 from bangerth/version-string

Provide a function that returns the version string.

Fix llvm-6 clang-tidy performance findings

Add a test that works on only a subset of MPI processes.

The test is intended to verify that we don't have stray references to MPI_COMM_WORLD.

Document the use of MPI_COMM_WORLD in MPI_InitFinalize.

Update a couple of things on how we generate output in the example steps.

Avoid the use of SynchronousIterator in step-9.

While there also mark a solution vector as a reference to avoid copying it.

Avoid the use of SynchronousIterator in step-14.

Point to the only tutorial program that uses this class.

Add a changelog entry.

Provide a function that returns the version string.

Merge pull request #6029 from bangerth/update-step-14

Avoid re-init'ing the same vector twice in step-14.

Avoid re-init'ing the same vector twice in step-14.

Merge pull request #6027 from bangerth/doc-update

Minor doc update to step-35.

Merge pull request #6003 from masterleinad/relaxation_block_set_kernel

Allow for setting the size of the kernel instead of a threshold in RelaxationBlock

Minor doc update to step-35.

Merge pull request #6024 from kronbichler/remove_mpi_comm_world

Do not use MPI_COMM_WORLD in MG Transfer

Remove use of MPI_COMM_WORLD in serial Trilinos vector.

Do not use MPI_COMM_WORLD.

Run the computation of projections from children in parallel.

Break the main part of a loop out of the loop and put it into a lambda.

Merge pull request #6020 from bangerth/doc-update

Improve documentation of FETools::compute_projection_matrices().

Merge pull request #6014 from kronbichler/improve_hermite_like_interp

Extend Hermite-like interpolation to case degree=2

Merge pull request #6021 from tjhei/cuda_documentation_fixes

CUDA: doxygen fixes

CUDA: doxygen fixes

- disable DEAL_II_ALWAYS_INLINE and __device__ in doxygen documentation
- avoid @ingroup for member functions because they will be moved not
copied to the group

Improve documentation of FETools::compute_projection_matrices().

Merge pull request #6012 from tjhei/cuda_warnings

CUDA: fix cmake 3.10 and remove warning

Merge pull request #6005 from jppelteret/fix_vector_from_trilinos_vector

Fix Vector::operator=(TrilinosWrappers::MPI::Vector)

Extend Hermite-like interpolation to case degree=2.

Merge pull request #6013 from tjhei/lapack_warnings

remove LAPACK warning about uninitialized info variable

remove LAPACK warning about uninitialized info variable

CUDA: fix cmake 3.10 and remove warning

Merge pull request #6009 from bangerth/doc-update-13

Better document one place.

Merge pull request #6008 from bangerth/cleanup-2

Better document a piece of code.

Merge pull request #6007 from bangerth/cleanup

Simplify code.

Merge pull request #6011 from tamiko/add-gitignore

Add a .gitignore file

Add a .gitignore file

Let's ignore the "code-gallery" directory and all directories starting
with "build*".

Add test for the read json parameter handler.

add json parser for input files.

Better document one place.

Better document a piece of code.

Simplify code.

The existing code seemed to suggest that something different had to happen if n_levels()>0.
But it was really that there was nothing to do if the triangulation is empty. Reflect this
in both the code and a comment.

Merge pull request #6006 from tjhei/cuda_doc

create CUDA doxygen module

Moved some header files to .cc

Allow for setting the size of the kernel instead of a threshold

cuda doxygen

Fix Vector::operator=(TrilinosWrappers::MPI::Vector)

Data was being copied to the local vector directly from the distributed
vector (as opposed to its localised equivalent). This lead to only a
partial copy of data, and all of the data was offset incorrectly in the
returned vector (giving each process a different view of the localised
vector).

Merge pull request #6004 from masterleinad/avoid_warnings_spherical

Avoid compiler warnings for Function::Spherical

Merge pull request #5995 from bangerth/doc-update

Expand on the discussion in the introduction to step-14.

Avoid compiler warnings for Function::Spherical

Merge pull request #5732 from Jie-Cheng/petsc_mmult_follow_up

Follow-up of #5655: add mmult and Tmmult to petsc sparse matrix and petsc parallel sparse matrix

Follow-up of #5655: add PETScWrappers::SparseMatrix::mmult and PETScWrappers::MPI::SparseMatrix::mmult

Split coupling.h into coupling.cc and coupling.inst

Added SPARSE_MATRICES to explicit instantiations.

Merge pull request #6000 from masterleinad/changelog_5997

Changelog entry for #5997

Changelog.

Changelog entry for #5997

Non matching sparsity and mass matrix.

Merge pull request #5997 from masterleinad/fix_distort_random

Fix up GridTools::distort_random for p::s::Triangulation

Merge pull request #5957 from masterleinad/move_support_qgausslobatto

Fix undefined functions in template instantiations

Merge pull request #5996 from masterleinad/fix_scalapack_hdf5

Guard HDF5 specific ScaLAPACK implementation