Fix restrictions and warnings for some tests

Merge pull request #7003 from masterleinad/restrict_bessel1

Restrict wave_number in constructor of Bessel1 to nonnegative values

Restrict wave_number in constructor of Bessel1 to nonnegative values

Merge pull request #6998 from masterleinad/improve_deprecation

Improve deprecation messages

Merge pull request #6968 from masterleinad/trilinos_wrappers_sparsity

Save the locally owned rows in TrilinosWrappers::SparsityPattern

Merge pull request #7000 from kronbichler/fix_high_order_vtk

Mark some variables as const in the high order VTK output

Mark some variables as const in the high order VTK output.

Merge pull request #6994 from agrayver/high_order_vtk

Add support for high-order VTK output

Merge pull request #6997 from masterleinad/fix_various_warnings_cdash

Fix various warnings

Improve deprecation messages

Fix various warnings

Merge pull request #6983 from marcfehling/variable-serialization

Implement variable size serialization.

Merge pull request #6996 from drwells/remove-jn

Use a C++17 function instead of jn.

Use a C++17 function instead of jn.

This is not guaranteed to be in the math library, but it is in C++17 (or in
boost).

Merge pull request #6328 from jppelteret/subscriptor_01

Make Subscriptor thread-safe & add general list_subscribers() function.

Rename function

Add a test for Bessel function values.

This verifies that the upcoming change produces the same results as the present
implementation.

Add a default value for component in Bessel1::value.

Fix position of a lock guard

Add a changelog entry for modifications to Subscriptor class.

Merge pull request #6924 from drwells/add-shells

Add shells

Merge pull request #6995 from marcfehling/cleanup-6920

Cleanup 'attach_data_02.output'.

Merge pull request #6957 from bangerth/doc-update

Update the documentation of GridTools::extract_used_vertices().

Merge pull request #6988 from tjhei/add-test-step-56

add test for examples/step-56

Merge pull request #6985 from agrayver/deprecate_pbvcc

Deprecate project_boundary_values_curl_conforming

Merge pull request #6986 from masterleinad/replace_petsc_parallel_headers

Rename petsc_parallel_* headers to petsc_*

Update tests

Address comments

Add changelog

Add support for high-order VTK output

Merge pull request #6861 from kronbichler/fix_evaluation_bug_1d

Fix bug in FEFaceEvaluation in 1D

Add changelogs.

Add test cases.

Enable 1D case in inverse mass matrix operator.

Fix bug in FEFaceEvaluation in 1D.

Cleanup 'attach_data_02.output'.

Implements variable size serialization.

Merge pull request #6967 from luca-heltai/boost-bounding-box

Boost bounding box

Add GridGenerator::concentric_hyper_shells.

This function generates a grid comprised of (as the name states) concentric
hyper shells, where the shells are (controlled by the skewness parameter)
clustered near the inner boundary.

Permit merging empty triangulations.

This is useful when we build triangulations by repeatedly merging triangulations
in a loop.

add header

indent

add test for examples/step-56

Merge pull request #6989 from tjhei/fix_geod_reference_step_18

Fix reference to step-18 in documentation

Fix reference to step-18 in documentation

Merge pull request #6987 from masterleinad/fix_warning_mpi_attach_data_02

Avoid warning in mpi/attach_data_02

Merge pull request #6960 from marcfehling/cleanup-6939

Prevent warnings introduced in #6936.

Avoid warning in mpi/attach_data_02

Rename petsc_parallel_* headers to petsc_*

Add change note

Deprecate project_boundary_values_curl_conforming

Merge pull request #5499 from jppelteret/ad-drivers

Implement driver interface for internally supported AD libraries.

Optimise and extend some of the functions in the AD drivers classes.

Update configuration to detect new ADOL-C "feature" :-/

Implement driver classes for internally supported AD libraries.

Merge pull request #6971 from GivAlz/Distr_documentation

Improved description compute point locations

Merge pull request #6955 from masterleinad/unused_variable_solution_transfer_unpack_callback

Avoid warning regarding unused variable in SolutionTransfer::unpack_callback

Merge pull request #6974 from masterleinad/indent_example-step-15

example/step-15: Update indenting and modernize

Merge pull request #6973 from tamiko/fix_cmake

CMake: Do not check for the geometry component in FindBOOST.cmake

example/step-15: Update indenting and modernize

CMake: Do not check for the geometry component in FindBOOST.cmake

Boost.Geometry is a header-only component of Boost. It is
unconditionally installed.

CMake does not support to configure with the "geometry" component
because it cannot pick up a corresponding library (is true at least for
versions 3.9, 3.10, 3.11, 3.12).

Thus, remove the geometry component from the find(Boost ...) call.

Closes #6969

Improved description compute point locations

Introduce TrilinosWrappers::SparsityPattern::row_is_stored_locally

Merge pull request #6920 from marcfehling/variable-transfer

Support for transfer of variable size data.

Merge pull request #6944 from luca-heltai/add-constructor-function-parser

Add new constructor to function parser

Merge pull request #6966 from masterleinad/restrict_p4est

Restrict tests requiring p4est

Save the locally owned rows in TrilinosWrappers::SparsityPattern

Some rtree tests with Points.

Support for transfer of variable size data.

Merge pull request #6962 from marcfehling/indentation-fe_collection_05

Fix indentation for 'tests/hp/fe_collection_05'.

Restrict tests requiring p4est

ChangeLog.

Added adaptor for bounding box.

Make sure also <deal.II/boost_adaptors/*.h> gets ordered

Renamed tests/boost/boost_* to tests/boost/*

Merge pull request #6963 from drwells/fix-generate_lapack_templates

Fix generate lapack templates

Improve generate_lapack_templates' documentation.

Fix execution of generate_lapack_templates.

Merge pull request #6950 from luca-heltai/boost-geometry

Added boost::point adaptor

Addressed Daniel's comments

Merge pull request #6823 from tjhei/cmake_deprecated_using

cmake check for using and DEAL_II_DEPRECATED

Fix indentation for 'tests/hp/fe_collection_05'.

Prevent warnings introduced in #6936.

Merge pull request #6958 from bangerth/make-virtual

Make it even clearer that a function is 'virtual'.

Merge pull request #6949 from masterleinad/avoid_warning

Avoid #warning using MSVC

Make it even clearer that a function is 'virtual'.

Merge pull request #6943 from jppelteret/ad-lac_static_asserts

Add AD number static asserts for FullMatrix and Vector classes.

Update the documentation of GridTools::extract_used_vertices().

Avoid warning regarding unused variable in SolutionTransfer::unpack_callback

ChangeLog

Added boost::geometry point adaptor for deal.II

Check if external boost library contains geometry.

Added boost/geometry.

Merge pull request #6928 from marcfehling/fixes-6880

Force same FE object for transferring data.

Merge pull request #6951 from bangerth/doc-update

Update the documentation of hp::FECollection::find_least_face_dominating_fe().

Merge pull request #6952 from bangerth/doc-update-2

Match doxygen markup in the .cc file to that in the .h file.

Merge pull request #6953 from masterleinad/ignore_deleted

Ignore deleted files when formatting

Ignore deleted files when formatting

Merge pull request #6942 from masterleinad/common_ancestor_formatting

Use common ancestor as base for formatting recent files

Match doxygen markup in the .cc file to that in the .h file.

This is necessary because we run both the .h and the .cc files through doxygen.
If we don't do this, then doxygen will show functions with different markup
twice in the online documentation.