Modified implementation in favor of a constant eccentricity manifold
Unit tests, comments, and pictures were modified accordingly.

Minor modifications

 - Adjusted style.
 - Used `std_cxx14` instead of `std` for `make_unique()`.
 - Added guard in `pull_back()` to prevent NaNs in `std::acos()`. This
 may happen due to numerical errors: when the argument of acos() falls
 outside the range [-1,1].

Included a special case for pull_back()

If the first coordinate is exactly 0, the center of the manifold is
returned.

Changelog entry added as minor/20181130StefanoDominici.
Minor modifications:
 * Formatted code to add three spaces after each function.
 * Extended the documentation in test elliptical_manifold_01.cc.
 * Added @copydoc to function declarations that were not showing up in
 the class documentation.
 * Fixed grammar.

Added EllipticalManifold to manifold_lib and tests

A new type of manifold was added to the manifold library.
An EllipticalManifold object, valid for <dim=2,spacedim=2>.

Two unit tests were added: elliptical_manifold_01.cc and
elliptical_manifold_02.cc.

Improved documentation and fixed minor bugs.

The pull_back() function has documented code in its body.
Moreover, the content of the function was modified to improve clarity
and fix minor bugs.

Improved documentation and restructured test 01

Test in elliptical_manifold_01.cc generates an hyper_shell triangulation
that is included in the class documentation in .png format.

Adjusted style and improved comments in tests

Used explicit template instantiation in manifold_lib.cc for pull_back()
and push_forward() functions.

Removed string constructors from class constructor

Added comment to get_periodicity() function.

Merge pull request #7432 from masterleinad/derandomize_cuda_device_test

Fix init_cuda

Fix init_cuda

Merge pull request #7431 from masterleinad/derandomize_cuda_device_test

Derandomize CUDA devices used in tests

Derandomize CUDA devices used in test

Merge pull request #7430 from masterleinad/fix_zero_length_cuda_array_view

Fix MemorySpace check for zero sized ArrayViews

Fix MemorySpace check for zero sized ArrayViews

Merge pull request #7411 from drwells/update-truncated-cone

Update GridGenerator::truncated_cone.

Merge pull request #7412 from masterleinad/cuda_array_view

MemorySpace template parameter for ArrayView

Unify is_in_correct_memory_space

Merge pull request #7424 from tamiko/fix_cmake_petsc

CMake: Remove a faulty list manipulation

Merge pull request #7370 from masterleinad/force_cuda_host_compiler

Force CUDA host compiler to be the same as the one used as C++ compiler

CMake: Remove a faulty list manipulation

Use cuda_init() in tests

Changelog entry

Restrict access to ArrayView::operator[] to CPU memory

Test correct memory space

Let ArrayView have a MemorySpace template parameter

Merge pull request #7422 from masterleinad/fix_windows_posix_threads

Only declare PosixThreadBarrier if there is POSIX support

Only declare PosixThreadBarrier if there is POSIX support

Merge pull request #7419 from bangerth/step-20

Rewrite the introduction of step-20.

Rewrite the introduction of step-20.

Merge pull request #7414 from masterleinad/support_gmsh_4

Gmsh' MSH file format version 4

Update CUDA information in the documentation for external libraries

Merge pull request #7398 from masterleinad/cuda_init

Introduce init_cuda in tests.h

Merge pull request #7417 from masterleinad/algorithm_header_subscriptor

Add missing header in subscriptor.cc

Add missing header in subscriptor.cc

Merge pull request #7410 from masterleinad/smart_pointer_check_dangling

Update description of Subscriptor and SmartPointer in the tutorials

Be more conservative with respect to the MSH file format version

Update description of the Subscriptor-SmartPointer pair in the examples

Increase thread-safety of Subscriptor

Merge pull request #7415 from davydden/feature/incremental_fix

set components correctly in IncrementalFunction

set components correctly in IncrementalFunction

Update GridGenerator::truncated_cone.

The 3D grid currently uses 4 coarse level cells on circular slices: this
is poorly conditioned since, when refined, some cells will converge to
triangles. This commit uses the five-square (implemented by
GridGenerator::hyper_ball<2>) to get a much better coarse grid.

Changelog entry

Support Gmsh-4

Merge pull request #7363 from masterleinad/smart_pointer_check_dangling

Make SmartPointer+Subscriptor check for dangling pointers

Changelog entries

Make SmartPointer+Subscriptor check for dangling pointers

Merge pull request #7396 from davydden/feature/interleave

add Utilities:: pack_integers() to pack an array of ints

Merge pull request #7402 from bangerth/sparsity

Fix (Dynamic)?SparsityPattern::begin() for empty sparsity patterns.

Merge pull request #7337 from marcfehling/cell-domination

Introduced 'compare_for_cell_domination'. Refactored 'compare_for_face_domination'.

Merge pull request #7401 from bangerth/abaqus

Add more run-time checks to the ABAQUS reader.

Merge pull request #7405 from bangerth/doc-update-2

Clarify the documentation of GridGenerator::cylinder().

Merge pull request #7406 from tjhei/doc_plate_with_hole

doxygen: scale plate_with_hole images

doxygen: scale plate_with_hole images

the .pngs are about 1500px wide so the display is quite ugly. 600px is
in line with most of the other images on the page.

Clarify the documentation of GridGenerator::cylinder().

Merge pull request #7375 from davydden/feature/incremental_function

Functions::IncrementalFunction

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

rename and improve documentation

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

Remove try-catch blocks in tests.

Merge pull request #7400 from bangerth/fix-widening

Ensure a left-shift operation happens in the right data type.

Merge pull request #7381 from davydden/feature/tmmult_dsp

rework DSP::compute_Tmmult_pattern() with iterators

Add a changelog entry.

Add a few tests.

Fix (Dynamic)?SparsityPattern::begin() for empty sparsity patterns.

Add more run-time checks to the ABAQUS reader.

Coverity complains about the use of the unchecked indices 'elid_start'
and 'elid_end' in the loop after reading them from an untrusted file.
Check at least their basic integrity. While there, also check that
commas are really commas.

Ensure a left-shift operation happens in the right data type.

Fix location AssertCuda

Introduce init_cuda

add mutex lock

improve IncrementalFunction

Merge pull request #7397 from tjhei/document_point_value

document VT:point_value better

improve documentation

Co-Authored-By: davydden <davydden@gmail.com>

document VT:point_value better

add Utilities::interleave() to interleave an array of ints into a single integer

Merge pull request #7394 from koecher/doc-doftools-coupling

enhanced documentation for DoFTools::Coupling::nonzero

enhanced documentation for DoFTools::Coupling::nonzero

Merge pull request #7392 from drwells/deprecate-netcdf

Deprecate the NetCDF bindings.

Merge pull request #7391 from drwells/update-step-57

Update step 57

Introduced 'compare_for_domination()' functions. Deprecated 'compare_for_face_domination()' functions.

Merge pull request #7393 from drwells/fix-doc-link

Fix a documentation link.

Deprecate the NetCDF bindings.

Merge pull request #7367 from masterleinad/make_cuda_tests_more_robust

Make CUDA tests more robust

step-57: Use blank lines after equations.

This improves pagination.

Fix a documentation link.

step-57: Reword some sentences for clarity.

step-57: Use pmatrix instead of arrays in TeX.

step-57: Reformat in-code TeX.

I also added a missing parenthesis.

step-57: Improve output format and variable names.

step-57: remove unused headers and code.

step-57: Improve typography.

1. Remove trailing whitespace.
2. Fix some minor spelling mistakes.
3. Consistently use MathJax for equations.

Add test to check that wrapper resets time state of wrapped class

Rename a test

Add guarentee that wrapper resets time state of wrapped class

Add an assertion

Improve class documentation

add IncrementalFunction

Merge pull request #7386 from masterleinad/real_time

Describe time by real scalar types in Function and friends

Merge pull request #7387 from davydden/feature/dsp_column_index

add  DynamicSparsityPattern::column_index()

add  DynamicSparsityPattern::column_index()

Prefer defining aliases instead of importing from base class

Introduce a time_type alias for Function and friends

Describe time by real scalar types in Function and friends

add unit tests

Merge pull request #7384 from bangerth/fix-warning

Fix a warning about an unused 'using' declaration in release mode.