remove muparser setting

do not allow bundled

fix clang tidy script

- fix additional args ($@)
- do not quote ARGS, otherwise it doesn't work

Merge pull request #7600 from drwells/remove-extra-semicolons

Remove unnecessary semicolons from source files.

Remove unnecessary semicolons from source files.

Merge pull request #7599 from Rombur/misc

CUDA instantiation

Remove unused code

Add missing instantiations for ditributed CUDA vectors

Merge pull request #7595 from masterleinad/loop-convert_5

Use range-based loops in dofs and distributed

Merge pull request #7596 from masterleinad/delete_fevalues_copy_constructor

Actually delete copy constructors for FEValues*

Actually delete copy constructors for FEValues*

Use range-based for loop in source/distributed

Use range-based for loop in source/dofs

Merge pull request #7594 from drwells/use-emplace-over-dtor

Use emplace_back over an in-place destructor/new.

Use emplace_back over an in-place destructor/new.

Merge pull request #7590 from masterleinad/loop-convert_4

Use range-based for loops in grid files

Use std::sets in GridOut::write_svg

Use range-based for loops in include/grid

Use range-based for loops in source/grid

Merge pull request #7586 from masterleinad/loop-convert_3

Use ranged-based for loops in hp

Merge pull request #7572 from marcfehling/fix-fourier

Fixed indices in FESeries::Fourier::set_k_vectors().

Merge pull request #7580 from masterleinad/more_fallthrough

Use more flags in [[fallthrough]] checks

Use range-based for loops in include/hp

Use range-based for loops in source/hp

Merge pull request #7575 from masterleinad/loop-convert_2

Use range-based for loops II

Merge pull request #7582 from bangerth/exception

Remove a pointless assertion.

Remove a pointless exception.

Merge pull request #7564 from GivAlz/CouplingMatrix

Optimizing NonMatching::create_coupling_mass_matrix

Merge pull request #7563 from GivAlz/CouplingSparsity

Optimizing NonMatching::create_coupling_sparsity_pattern

Use more flags in [[fallthrough]] checks

Use range-based for loops in source/non_matching

Use range-based for loops in source/opencascade

Use range-based for loops in source/particles

Merge pull request #7020 from dangars/hdf5

Add HDF5 classes

Merge pull request #7567 from bangerth/doc-update

Update some documentation.

Changelog entry

Improve the documentation

Reorder functions get/set_query_io_mode()

Add functions set_plist() and release_plist()

Remove std::vector copy

Use const reference instead of rvalue

Create a list with a more clear syntax

Specify the argument in the lambda funcions

Generic lambdas is a C++14 feature

Make the arguments const

Add get_name()

Make const the functions open_* and create_*

Use make_array_view(container_object).data()

Obtain a pointer to the container raw data using make_array_view(container_object).data(). Remove the functions get_container_pointer().

Improve the documentation

Rename group() to open_group()

Make get_attribute const

Reorder parameters

Add test hdf5_06

The test hdf5_06 is the serial version of hdf5_05

Add test for Vector and write/read selection

Use Container in read_selection and write_selection

Use overload instead of enable_if

Make herr_t ret local variable

Rename enum Mode

Improve the documentation

Modify the location of clang off

Add in the documentation the MPI requirements

Fix typos

Rename dataset() to open_dataset()

Add complex=off for the test hdf5_05

Add hdf5_05.mpirun=1.output

Add tests in tests/base/hdf5_05.cc

Add read_hyperslab()

Squeeze the dimensions of FullMatrix in initialize_container()

Add test hdf5_05

The test hdf5_05 is based on the test hdf5_03

HDF5 tests with_complex_values=off

Add the option "with_complex_values=on" in the output files of the tests

Declare variables as const

Improve the documentation

Thread safety documentation

Modify the hyperslab documentation

Use two functions instead of a template

Instead of a templated get_io_mode() function. Two functions have been defined:
- std::string get_io_mode();
- H5D_mpio_actual_io_mode_t get_io_mode_as_hdf5_type();

And the same for get_local_no_collective_cause() and get_global_no_collective_cause()

Rename functions

Separate functions by three empty lines

Use make_shared in get_hdf5_datatype()

Document the constructors of Group and File

Use lambda function in no_collective_cause_to_string()

Improve the documentation

Document helper functions

Document valid Containers

Document read_selection() and write_selection()

Use @p for arguments in the documentation

Document initialize_container

Fix typo

Documentation of the rank of HDF5 datasets and hyperslabs

Replace template template Containers by template Containers

Merge pull request #7569 from GivAlz/AddTestGlobalTree

Add test and support for non-mpi to GridTools::build_global_tree

Improve the documentation

Improve the documentation of hyperslab

Document hdf5_reference std::shared_ptr<>

Document DataSet constructors

Pass parameters by reference

Move enum Mode

Define mpi variable as const

Rename check_io_mode() to query_io_mode()

Improve the documentation

Modify copyright years

Remove clang on/off

Use backticks for the types

Add endline

Add Asserts

Remove the warnings of unused variables

There are many warnings of unused variables in release mode because of Assert. Example:

herr_t ret;
ret = H5Pclose(plist);
Assert(ret >= 0, ExcMessage("Error at H5Pclose"));

In order to remove these warnings the declaration of variable ret has been moved from the functions to the class definition of HDF5Object.

Format code

Remove irrelevant curly brackets

Write serial tests for the HDF5 datasets

Use generic container for write_dataset

Add support for Vector

Place most of the instantiations in hdf5.inst.in

Write parallel tests for the HDF5 datasets

Add examples

Use hex values instead of enum values

Hex codes are used because the HDF5 Group can deprecate some of the enum codes. For example H5D_MPIO_FILTERS is not defined in 1.10.2 because it is possible to use compressed datasets with the MPI/IO driver.

Remove long double and std::complex<long double> instantiations

The std::complex<long double> instantiation creates errors with valgrind.

Although long double does not create errors with valgrind, it is not a widely used.

Fix doxygen documentation

Replace the template argument T by number

Add functions read_*()

Add read_selection()

Add read_hyperslab()

Add read_none()