Modernize step-17

Merge pull request #7752 from GivAlz/GuessOwnerTree

New function GridTools::guess_point_owner from covering tree

Merge pull request #8002 from luca-heltai/mapping-bbox

Mapping::get_bounding_box()

Merge pull request #8009 from jppelteret/sd-map_utilities_05

SD map operations:  Add function to resolve explicit and cyclic dependencies

Merge pull request #7638 from jppelteret/ad_numbertype_none

Add AD::NumberType::none

Merge pull request #8065 from kronbichler/dof_renumbering_cleanup

DoFHandlerPolicy::renumber_dofs: skip unnecessary index set computation

Merge pull request #8081 from drwells/deprecate-nanoflann

Deprecate nanoflann.

Merge pull request #8087 from drwells/update-relative-to-step-20

Update documentation relative to other changes.

Merge pull request #8071 from drwells/fix-array-initializer

Fix an array initialization.

Merge pull request #8074 from kronbichler/deprecate_feeval_fill_JxW_values

Deprecate FEEvaluation::fill_JxW_values

Update documentation relative to other changes.

In f21656e3fd2 we switched to using LinearOperator in step-20, which
made some other references to that program no longer make sense. This
commit updates said references.

Merge pull request #7978 from tamiko/refactor_cuda_aware_mpi

Refactor configuration option into DEAL_II_MPI_WITH_CUDA_SUPPORT

Merge pull request #7628 from dangars/canonical_documentation

Use canonical webpages

Better document some template parameters

Make consistent the use of some doxygen keywords

Add function to resolve explicit and cyclic dependencies in sub. maps

Merge pull request #8069 from drwells/modernize-step-32

Modernize step 32

Add a changelog entry

Merge pull request #7933 from marcfehling/weights-artificial

Minor cleanup of hp::DoFHandler.

Update existing AD number traits tests

This deals with the increment in the ADNumberTypes enumeration

Add AD number traits test for ADNumberType::none (floating point types)

Instantiate ADHelpers classes with AD::NumberTypes::none.

The creation of a concrete instance of this class is, however, disabled.
This is because the class will not be able to do anything useful.

Instantiate ADDrivers classes with AD::NumberTypes::none.

Change std::is_arithmetic to std::is_floating_point in ad_number_traits.h

Add dummy AD::NumberTypes::none for floating point number types

These number types are scalar arithmetic types, that hold no
derivatives. They are implemented primarily to facilitate the use of
template meta-programming techniques to switch between different AD
types. This covers the case when the user does not want an AD type at
all, but rather a primitive type.

Avoid a warning about an unused variable

Fix two tests missed in #8018.

Merge pull request #8078 from sophy1029/step-61

step-61 announcement.

Merge pull request #7743 from GivAlz/OptimizeCptLoc

Using rtrees in GridTools::compute_point_locations_try_all for cell search

Minor update to a changelog entry.

Merge pull request #8034 from drwells/fix-move-warnings

Remove some unnecessary std::moves.

Merge pull request #8063 from masterleinad/fix_clang_4_warnings

Fix clang-4 warnings

Deprecate nanoflann.

We have reached a consensus that boost's rtree is superior.

Merge pull request #8073 from marcfehling/fe-changelog

Adjusted changelog for #7899.

Deprecate FEEvaluation::fill_JxW_values

Adjusted changelog for #7899.

Add constant get_boundary_points().

Use the new constructor for Mapping::get_bounding_box()

Documentation fixes.

Add the possibility to build bounding boxes with containers of points.

Mention that we can still access the old index sets in DoFHandler

Use local communication completely for same locally owned dofs

Be a bit more verbose documenting DEAL_II_MPI_WITH_CUDA_SUPPORT

Merge pull request #8020 from tjhei/step-keywords

tutorials: add keywords

Fix an array initialization.

GCC 4.8 complains about the brace initialization:

./source/grid/manifold_lib.cc:1804:75:
warning: missing initializer for member 'std::array<double, 12ul>::_M_elems'
[-Wmissing-field-initializers]
         std::array<double, GeometryInfo<3>::lines_per_cell> weights_lines{};
                                                                           ^

so be safe and initalize explicitly with fill.

Merge pull request #8047 from davydden/feature/dsp_view

Add DynamicSparsityPattern::get_view()

add a short documentation entry

Refactor configuration option into DEAL_II_MPI_WITH_CUDA_SUPPORT

Minor cleanup of hp::DoFHandler.

Add changelog

DoFHandlerPolicy::renumber_dofs: skip unnecessary index set computation

step-32: remove parallel projection code.

VectorTools::project has learned how to project with distributed
Triangulations.

Merge pull request #8066 from kronbichler/fix_step_31

Make step-31 compile again

step-32: fix an incorrect filtering criterion.

step-32: update description of Aspect.

Its no longer a hypothetical project.

Merge pull request #8021 from tjhei/p4est_access

provide access to p4est_t

step-32: C++ modernization.

1. Use constexpr where appropriate
2. use ranged-for loops
3. avoid using update_q_points (its deprecated)

step-32: minor typography fixes.

Merge pull request #8030 from drwells/nanoflann-1.3

Fix compatibility with nanoflann 1.3.

Merge pull request #8032 from davydden/feature/hsfc_degenerate

Improve inverse_Hilbert_space_filling_curve to handle degenerate cases

Merge pull request #8048 from davydden/feature/mpi_mean_std

add Utilities::MPI::mean_and_standard_deviation()

Merge pull request #8062 from bangerth/nedelecsz

Update a few sentences in the description of the NedelecSZ element.

Make step-31 compile again

New function GridTools::guess_point_owner which takes as input an rtree and a vector of points

Merge pull request #8053 from jppelteret/meshloop-doc_01

Add some examples to the mesh loop documentation

Merge pull request #8059 from drwells/modernize-step-31

Modernize step 31

Merge pull request #8057 from bangerth/cleanup

Clean up various loops in grid_tools.cc.

Fix clang-4 warnings

Update a few sentences in the description of the NedelecSZ element.

Merge pull request #8061 from bangerth/br

Add some more information on the BR element.

Add some more information on the BR element.

Merge pull request #8056 from bangerth/partition

Simplify the code that partitions shared triangulations.

Merge pull request #8051 from masterleinad/fix_gcc_9_warnings

Fix gcc-9 warnings

Merge pull request #8044 from drwells/modernize-step-30

Modernize step 30

Merge pull request #8055 from bangerth/61

Make the polynomial degrees in step-61 selectable.

step-31: inline function definitions.

step-31: C++ modernization

step-31: minor typography improvements

1. Use MathJax instead of, e.g., <i>T</i>
2. Add commas after i.e.,
3. Minor grammatical improvements

Merge pull request #8046 from masterleinad/modernize-step-52

Modernize step-52

Clean up various loops in grid_tools.cc.

These loops were quite contorted because of workarounds we needed for MS VC.
Using 'auto' should make this substantially more obvious to read, and while
there one can also use range-based for loops.

Avoid declaring special member functions

Avoid signed-unsigned comparison

Match explicitly defined copy constructors with copy assignment operators

Apply the same logic in the other place where we call the cell weight signal.

Simplify the code that partitions shared triangulations.

In particular, only call the cell weight signal on locally owned cells.

add Utilities::MPI::mean_and_standard_deviation()

Make the polynomial degrees in step-61 selectable.

step-30: minor modernizations.

1. Inline function definitions.
2. Remove unnecessary class destructor.
3. More modernization: std::abs, std::array.
4. Reorganize the headers
5. Minor formatting and whitespace improvements
6. remove a second mention of a deleted member of GeometryInfo

step-30: Remove references to an old version of step-12.

Add DynamicSparsityPattern::get_view()

Merge pull request #8038 from kronbichler/cleanup-step-48

Modernize step-48

Merge pull request #8050 from drwells/step-62-loop

Add some missing braces to fix step-62.

Merge pull request #8052 from masterleinad/fix_step_62_adding_real_complex

step-62: Fix adding real and complex numbers

Add examples for mesh_loop() when filtered iterators are to be used.

Fix a typo in the mesh_loop() example.

step-62: Fix adding real and complex numbers

Merge pull request #8039 from kronbichler/modernize-step-51

Modernize step-51

Merge pull request #7822 from marcfehling/hp-execute-3

Perform p-refinement during 'execute_coarsening_and_refinement()'.

Add some missing braces to fix step-62.

Modernize step-48

1. Extend documentation a bit
2. Use zeroing of vector in matrix-free loop
3. Update program output to a new machine; here it is more typical that MPI is better than threads
4. Rename ExactSolution -> InitialCondition because it is not the exact solution over time