Fix data of log files

Merge pull request #8797 from kronbichler/speedup_multigrid_init

Allow multigrid transfer to use external vector partitioners

Merge pull request #9041 from kronbichler/remove_unused_variable

Avoid warning about unused variable

Changelog

Test case

Allow multigrid transfer to use external vector partitioners

Avoid warning about unused variable

Merge pull request #9038 from Rombur/cuda_volatile

Make variable volatile to avoid incorrect optimization

Make variable volatile to avoid incorrect optimization

See https://devtalk.nvidia.com/default/topic/965588/race-condition-within-warp/

Merge pull request #9039 from jodlbauer/quadratures

Add more choices to QuadratureSelector

Merge pull request #9025 from tjhei/timer_output_spam

remove TimerOutput error spam

Add more choices to QuadratureSelector

Merge pull request #9033 from peterrum/compute_point_to_point_communication_pattern_nbx

Use ConsensusAlgorithm_NBX in compute_point_to_point_communication_pattern

Merge pull request #9035 from peterrum/consensus_algo_comment

Add missing doxygen comment in ConsensusAlgorithm

Merge pull request #9024 from tjhei/index_set_64

64bit fixes for IndexSets

Add missing doxygen comment in ConsensusAlgorithm

Rewrite compute_point_to_point_communication_pattern so that it uses ConsensusAlgorithm_NBX for MPI 3.0

Merge pull request #9022 from Rombur/warpsize

Do not hardcode the warp size

Merge pull request #9030 from tamiko/fix_tpetra_check

configure trilinos: Ensure that we are linking against MPI for Tpetra configure check

configure trilinos: Ensure that we are linking against MPI for Tpetra configure check

Merge pull request #9026 from masterleinad/revert_8976

Revert "added stl read/write functions"

Merge pull request #9027 from peterrum/dofhandler_docu_fix

Add missing bracket in docu of DoFHandler

Add missing bracket in docu of DoFHandler

Revert "added stl read/write functions"

This reverts commit 30df5d2033e8fa9a3eb0b0e01da04d34c090b270.

address comment

remove TimerOutput error spam

TimerOutput produces output on each MPI rank when an exception is
thrown. This makes looking at output with 100k MPI ranks somewhat
annoying. Fix this by only outputting on rank 0.
This assumes that also rank 0 triggers this exception, which might not
be true. In that case, we would likely deadlock anyways...

fix comment

fix output

fix index types

add test

fix complete_index_set

Do not hardcode the warp size

Merge pull request #9020 from masterleinad/missing_header

Add missing header

Add missing header

Merge pull request #9013 from masterleinad/fix_hp_cell_weights_tests

Fix hp_cell_weights tests

Merge pull request #9016 from Rombur/step_54

Add missing namespace

Merge pull request #9017 from bangerth/20

Minor updates to the documentation of step-20.

Minor updates to the documentation of step-20.

Merge pull request #9012 from masterleinad/fix_fullydistributed_grids_copy_serial_test

Fix test output for fullydistributed_grids/copy_serial_tria

Add missing namespace

Merge pull request #8419 from dangars/phase_shift_periodic_constraints

Bloch periodic conditions (a.k.a. phase shift periodic conditions)

Merge pull request #9014 from rezarastak/dof_tools_doc_fix

small documentation fix in DoFTools

small doc typo fix in DoFTools

Fix hp_cell_weights tests

Fix test output for fullydistributed_grids/copy_serial_tria

Merge pull request #9005 from jodlbauer/master

Allow change of SIMD type via template argument

Merge pull request #9002 from tjhei/comm_by_const_ref

return MPI_Comm by const ref

Merge pull request #8976 from nicola-giuliani/stl_handling

added stl read/write functions

Fix Boost.Python CMake (#9011)

Fix Boost.Python CMake

Unset Boost_FOUND to get Boost.Python properly configured

Merge pull request #8994 from kronbichler/simplify_index_owner_internal

Slightly simplify MPI::ComputeIndexOwner::Dictionary range detection

Merge pull request #9008 from peterrum/indent-message-hint

Add a hint to the indention script

Add a hint to the indention script

added stl read/write functions

post comments from wolfgang

added changes

Merge pull request #8962 from peterrum/gridout-vtk-optional-all

Output all faces and edges to vtk

Add SIMD type to template list of MF-Operators

Merge pull request #9003 from tjhei/index_set_add_indices_64

fix 64bit IndexSet::add_indices

changelog

Output all faces and edges to vtk

Merge pull request #9001 from tjhei/use_collective_mutex2

protect more MPI communication with a CollectiveMutex

fix 64bit IndexSet::add_indices

the offset parameter needs to be 64 bit to allow shifting an IndexSet in
a large computation.

part of and hopefully a fix for #8937

return MPI_Comm by const ref

Fix a few places where we return the MPI_Comm by value. This is
problematic if we pass it to a function taking a reference and storing
it:

    CollectiveMutex::ScopedLock lock(mutex, tria.get_communicator());

do not take a reference to the communicator

protect more MPI communication with a CollectiveMutex

- also replace a MPI_Probe with MPI_ANY_TAG

Merge pull request #8997 from tjhei/use_collective_mutex

use MPI::CollectiveMutex in several places

Merge pull request #8998 from rumajo/fix_gmsh_compilation

Fix compilation of gmsh support

move mutex down

use MPI::CollectiveMutex in several places

Merge pull request #8933 from tjhei/wait_all_consensus

Avoid empty MPI_Waitall in consensus algorithm

Merge pull request #8996 from masterleinad/use_face_iterators_tutorial

Use face_iterators in tutorials

Merge pull request #8964 from tjhei/mpi_wait_finalizer

implement MPI::CollectiveMutex

Fix compilation of gmsh support

Use std::ofstream rather than just ofstream.

Improve style

MPI_InitFinalize request tracking and MPI::CollectiveMutex

- implement mechanism to keep track of open MPI_Request
- implement CollectiveMutex
- add tests

Use face_iterators in tutorials

Implement face_iterators for DoFCellAccessors

Merge pull request #8981 from peterrum/matrixfree_readcelldata

Add new read_cell_data to FEEvaluationBase for arbitrary data types

Merge pull request #8983 from peterrum/matrixfree-pbc-hn-fix

Fix Matrixfree for periodic faces and hanging nodes

Slightly simplify MPI::ComputeIndexOwner::Dictionary range detection

Merge pull request #8982 from peterrum/pft-pbcfix

Fix create_construction_data_from_triangulation for periodic boundaries

Merge pull request #8979 from agrayver/fix_copy_tria

Do not transfer the MPI communicator when copying the triangulation

Fix Matrixfree for periodic faces and hanging nodes

Fix create_construction_data_from_triangulation for periodic boundaries

Merge pull request #8989 from winnifried/master

Added changes entry for pull request #8973

Do not transfer the MPI communicator when copying the triangulation

Merge pull request #8992 from tjhei/fix_agrayver_mailmap

fix agrayver username

fix agrayver username

fixes #8990

changed notation as suggested by David Wells

Merge pull request #8984 from bangerth/61

Update the discussion about broken RT space in step-61.

Fix typo

Merge pull request #8987 from bangerth/simplify

Use identity<...>::type in the right place.

Merge pull request #8986 from tjhei/intel_system_include_fix

disable intel system includes

Merge pull request #8988 from bangerth/space

Be consistent with spaces.

Added changes entry for pull request #8973

Be consistent with spaces.

Merge pull request #8985 from dougshidong/fix_derivativeform_template

Fix templating of some DerivativeForm functions.

Use identity<...>::type in the right place.

Add changelog entry

Merge pull request #8968 from agrayver/fix_python_cmake

Fix python bindings configuration for new boost

Make python a required package and remove old lines