Merge remote-tracking branch 'upstream/master' into jihuan-tian-contrib

Add a description file for the fix committed in c4b096d

Merge pull request #9237 from tjhei/trilinos_muelu_optional

make MueLu optional in Trilinos

Merge pull request #9278 from tjhei/single_level_data_out

test DataOut set_cell_selection for multilevel cells

update tests, disable muelu tests

Correct the printed message output from ExcInvalidBoundaryFunction()

make test work without mpi

Merge pull request #9499 from peterrum/matrixfree_new

Remove most new in folder include/deal.II/matrix_free/

Merge pull request #9004 from BrettDong/icc

Add a check on whether LLD links shared object

Remove most new in folder include/deal.II/matrix_free/

Merge pull request #9160 from peterrum/ecl-loop

ECL: add loop_cell_centric

Merge pull request #9494 from peterrum/matrixfree_hold_all_faces_to_owned_cells_fix

Matrixfree hold all faces to owned cells fix

Merge pull request #9492 from peterrum/arrayview_scalar

Add new constructor to ArrayView

Merge pull request #9498 from masterleinad/fix_more_gmsh

Fix more Gmsh references

Fix more Gmsh references

Merge pull request #9496 from agrayver/fix_step_49

Avoid automatic referencing

Avoid automatic referencing

Add loop_cell_centric

Update documentation

Initialize entry 4 and 5 of IndexStorageVariants::vector_partitioner_face_variants

Add new constructor to ArrayView

CMake: Simplify configuration logic

Merge pull request #9429 from agrayver/add_python_gridtools_method

Add python bind for compute_aspect_ratio_of_cells

Merge pull request #9472 from kronbichler/timer_print_statistics

Add function to print statistics over MPI for TimerOutput

Fix const-ness

Use io saver class to restore flags/precision/width

Also allow to print quantiles

Merge pull request #9216 from Rombur/mf_hp_dofhandler

Extend MatrixFree::get_dof_handler

Merge pull request #9488 from masterleinad/instantiate_extract_hanging_node_dofs

Add missing instantiations for DoFTools::extract_hanging_node_dofs

Merge pull request #9220 from masterleinad/test_python_bindings

Test python bindings

Merge pull request #9379 from krishnakumarg1984/attemp2_fix_boundaryid_manifoldid

Simplifies the example code for glossary entries of boundary_id and manifold_id

Documentation: Simplify example code for boundary_id and manifold_id

This commit simplifies and modernizes a code snippet in the glossary
entries of boundary_id and manifold_id

In reference to #9320

silence unused variables warning

Add changelog entry

Template function MatrixFree::get_dof_handler() to work with
hp::DoFHandler

Add missing instantiations for DoFTools::extract_hanging_node_dofs

Add a check on whether LLD links shared object

Merge pull request #9487 from lpsaavedra/fix-step-40-typo

Fix rhs typo in introduction of step-40

Fix rhs typo in introduction of step-40

Merge pull request #9478 from bangerth/20-3

Say something about local conservation in step-20.

Merge pull request #9483 from masterleinad/ignore_check_for_merges

Ignore merge commits in author check

Merge pull request #9482 from rumajo/fix_index_step_12

Fix subscript in step-12 intro

Fix subscript in step-12 intro

Merge pull request #9486 from bangerth/rename

Move a changelog entry.

Move a changelog entry.

Merge pull request #9484 from simonsticko/asserts_sparsity_pattern_add

Add an assert on row index in SparseMatrix::add(..)

Merge pull request #9481 from bangerth/undo

Revert introduction of deprecated functions.

Add an assert on row index in SparseMatrix::add(..)

Ignore merge commits in author check

Merge pull request #9480 from tjhei/function_map_doc

improve FunctionMap deprecation message

improve FunctionMap deprecation message

I was confused by this help message and decided to clarify. Also fix one
occurrence of FunctionMap in a code example.

Add a changelog entry.

Revert introduction of deprecated functions.

In #6830, @masterleinad introduced a whole bunch of functions that retained
backward compatibility for functions that @davydden had changed in #6818.
This was before the 9.1 release. It is time to remove these backward
compatibility functions again.

Say something about local conservation in step-20.

Merge pull request #9457 from jppelteret/improve_symmetric_tensor_and_tensor_01

Improve some operations in symmetric tensor and tensor

Merge pull request #9476 from bangerth/face_indices-2

Convert more places to use GeometryInfo::face_indices().

Merge pull request #9477 from bangerth/face_indices-3

Convert one more place for GeometryInfo::face_indices().

Merge pull request #9435 from bangerth/deprecated

Avoid using deprecated functions

Convert one more place for GeometryInfo::face_indices().

Avoid use of deprecated DoFTools functions in tests/.

Avoid the use of deprecated functions in tutorials.

Avoid the use of deprecated functions in DoFTools.

Add missing instantiations.

Rename a deprecated function.

Convert more places to use GeometryInfo::face_indices().

Merge pull request #9470 from bangerth/20

Address a question on the mailing list about step-20.

Clarify something about the matrix in step-20.

Add python bind for compute_aspect_ratio_of_cells

Merge pull request #9393 from krishnakumarg1984/step7_fix_norms

In step-7, removes the explicit listing of various norms since the list is anyway outdated

Merge pull request #9428 from agrayver/add_quadrature_python_binds

Add python wrappers for Quadrature

Merge pull request #9467 from bangerth/faces

Use cell->face_iterators() or GeometryInfo::face_indices() in the tutorials.

Fix indentation

Merge pull request #9471 from peterrum/consensus_template

Move implementation of ConsenusAlgorithm into mpi.templates.h

add comments

Add test case

Merge pull request #9466 from bangerth/dataout

Fix an overzealous assertion related to Dataout

Add MPI statistics to TimerOutput

Avoid setting up an MPI data type for serial comm

Merge pull request #9468 from bangerth/bb

Update documentation of NeighborType.

Merge pull request #9469 from tamiko/fix_test_regex

CMake: Make TEST_PICKUP_REGEX stricter

Move implementation of ConsenusAlgorithm into mpi.templates.h

Merge pull request #9465 from peterrum/consensus_change_type

Fix types in ConsensusAlgorithmProcess

CMake: Make TEST_PICKUP_REGEX stricter

When applying TEST_PICKUP_REGEX we now only match against
"${category}/${basename}" of a test (excluding all configuration options
after the first period (".").

Closes #9420

Update documentation of NeighborType.

Use cell->face_iterators() or GeometryInfo::face_indices() in the tutorials.

Add a changelog entry.

Add a test.

Fix an overzealous assertion.

Fix types in ConsensusAlgorithmProcess

Merge pull request #9464 from tjhei/doxygen_fixes2

doxygen documentation fixes

Use constructor instead of operator= in SymmetricTensor operations

Preferentially initialise values as doubles in SymmetricTensor

Merge pull request #9463 from bangerth/dataout

Really minor stuff.

doxygen documentation fixes

Merge pull request #9456 from jppelteret/fix_compiler_error_01

Fix SymmetricTensor and Tensor ProductType

Merge pull request #9458 from jppelteret/fix_trilinos_sacado_cmake_test

Fix a broken Trilinos Sacado CMake test

Merge pull request #9461 from masterleinad/fix_doftools_doxygen

Add a missing @endcode in DoFTools documentation

Add a missing @endcode in DoFTools documentation

Add missing include to a Trilinos Sacado CMake test

Preferentially use internal number cast operation in SymmetricTensor