Reduce possibility for roundoff in DataOut VTU test

Do not use FE_Q in MappingQGeneric

Merge pull request #9829 from kronbichler/extend_fe_tools

FETools: Add additional lexicographic_to_hierarchic_numbering functions

Merge pull request #9710 from kronbichler/improve_distribute_sparsity_pattern

SparsityTools::distribute_sparsity_pattern with compute_index_owner

Merge pull request #9881 from rezarastak/patch-1

Tiny Cmake documentation fix

Merge pull request #9741 from nfehn/parse_input

Extend ParameterHandler::parse_input() for file-type-independent parsing with inbuilt correctness check

extend function parse_input() for file-type-independent parsing

Tiny Cmake documentation fix

Merge pull request #9877 from rezarastak/numbers_types_includes

update included std headers in number.h and types.h

Merge pull request #9879 from dangars/cmake_documentation_center

Center comment

Center comment

Merge pull request #9874 from peterrum/dofhandler_mf

Merge MatrixFree::internal_reinit for DoFHandler and hp::DoFHandler

Merge pull request #9875 from peterrum/mf_level

Remove MatrixFree::DoFHandlers::level

Remove MatrixFree::DoFHandlers::level

Merge MatrixFree::internal_reinit for DoFHandler and hp::DoFHandler

include statements for standard headers improved

Merge pull request #9870 from kronbichler/fix_tests

Fix three tests

Merge pull request #9865 from dangars/cmake_documentation

Improve CMake documentation for google search

Merge pull request #9863 from dangars/step_69_cmake_threads

Use #ifdef to guard std::async in step-69

Merge pull request #9872 from tjhei/doxygen_extract_private

doxygen: enable private again

Update html links

doxygen: enable private again

fixes #9855

Merge pull request #9830 from rezarastak/tensor_doc

Doc of Tensor and SymmetricTensor improved.

Merge pull request #9866 from masterleinad/fix_gcc_tbb_warning

Fix gcc warning in TBB

Merge pull request #9871 from masterleinad/fix_get_boundary_ids_test

Minor fixes to get_boundary_ids_01

Minor fixes to get_boundary_ids_01

Merge pull request #9812 from peterrum/get_boundary_ids_parallel

Fix get_boundary_ids() and get_manifold_ids() for parallel triangulations

Fix gcc warning in TBB

Add output variant for another test (change due to FMA)

Add output variant for a test (change due to FMA)

Update output file without vectorization

Changelog

Update tests to new distribute_sparsity_pattern

Simplify distribute_sparsity_pattern in examples

Use faster distribute_sparsity_pattern within library

distribute_sparsity_pattern with locally owned dofs only

Merge pull request #9855 from tjhei/doxygen_extract_all

doxygen: extract everything

Merge pull request #9869 from drwells/fix-bbox-table

Fix a doxygen table.

Fix a doxygen table.

Doxygen has its own syntax for tables.

Merge pull request #9856 from luca-heltai/github-ci-windows

Added windows build to github-ci

Fix if statement

Use #ifdef to guard std::async

Merge pull request #9864 from tjhei/ci_ga_checkout_v2

CI: github actions: checkout@v2

Rename cmake.html and cmakelists.html

Rename cmake.html and cmakelists.html to cmake_dealii.html and cmake_user.html

Use a short title for google search

CI: github actions: checkout@v2

update checkout action to @v2. This should avoid errors when rerunning a
job about "reference is not a tree".

Doc of Tensor and SymmetricTensor improved.

Merge pull request #9860 from masterleinad/remove_more_deprecation

Remove more deprecations

Merge pull request #9861 from masterleinad/improve_cell_weihts_doc

Improve CellWeights documentation

Merge pull request #9852 from simonsticko/bounding_box_fixes

Minor fixes to BoundingBox

Improve CellWeights documentation

Merge pull request #9859 from masterleinad/doxygen_fixes

Some doxygen fixes

Merge pull request #9854 from dangars/cross_compiling_documentation

Update the cross compilation documentation

Remove some deprecated functions and variables

Update the cross compilation documentation

Some doxygen fixes

Merge pull request #9858 from kronbichler/test_fixes

Fix two tests with roundoff problems

Merge pull request #9376 from luca-heltai/read-write-vtu

Read and write vtu files

Relax absolute tolerance on test with numbers up to 1e9

Make test more robust by printing some data

Three small documentation fixes related to BoundingBox.

Move function coordinate_to_one_dim_higher to an internal namespace.

Merge pull request #9857 from kronbichler/output_variant_grid_generator_01b

Output more digits for test grid/grid_generator_01b

Fix get_boundary_ids() and get_manifold_ids() for parallel triangulations

Output more digits in test grid/grid_generator_01b

Changelog

Avoid use of deprecated functions in tests

Deprecate old functions and use the new one

Use new functions in FE_Q and MappingQEulerian

Add additional lexicographic_to_hierarchic_numbering functions

Added windows build.

Merge pull request #9850 from bangerth/discrete-time

Document the mental model of DiscreteTime.

Merge pull request #9683 from kronbichler/mf_remove_cells_close_to_bdry

MF: No special treatment of cells close to proc interface

Write and read VTU format that contains serialized triangulation.

Merge pull request #9817 from bangerth/compiler-versions

Require gcc 4.9 and clang 4.0.

Merge pull request #9848 from tjhei/ci_github_actions_linux

[CI]: add GitHub actions linux release build

Merge pull request #9851 from tjhei/ci_ga_remove_release_osx

do not build release on github actions OSX

Merge pull request #9777 from agrayver/step_53_python

Add Python version of step-53

MF: No special treatment of cells close to proc interface

doxygen: extract everything

doxygen has a bug to not extract global enums (see #7730). The only
current know option is to change the default to extract everything by
setting EXTRACT_ALL=YES.
Also add other options while we are here and enable generating
documentation for undocumented members/classes.

add linux release build

Document the mental model of DiscreteTime.

Merge pull request #9849 from masterleinad/fix_tests_werror

Fix some warnings in tests with clang-10

Rename function create_unit_box() to create_unit_bounding_box().

Merge pull request #9846 from kronbichler/documentation_noncontig_partitioner

Update documentation of NoncontiguousPartitioner

do not build release on github actions OSX

revert #9844

Github only does 5 parallel OSX builds per projectand now each of them
takes close to 2 hours. This is a bit too slow.

Merge pull request #9815 from bangerth/complex-vectors

Allow outputting complex-valued vector and tensor fields

Fix unused warning

Fix some warnings in tests with clang-10

Merge pull request #9819 from peterrum/compute_union

Add Utilities::MPI::compute_set_union

Merge pull request #9718 from nfehn/parameter_handler

improve robustness and usability of ParameterHandler

Merge pull request #9845 from rezarastak/doxygen_warnings_1

Fix some Doxygen warnings

Merge pull request #9831 from simonsticko/hypercube_to_bounding_box

Implement functionality from Hypercube on BoundingBox

Merge pull request #9844 from masterleinad/build_debug_and_release

Build debug and release with Actions

improve usability of ParameterHandler

Slightly reformulate documentation of BoundingBox

Co-Authored-By: Martin Kronbichler <kronbichler@lnm.mw.tum.de>

Merge pull request #9821 from masterleinad/remove_shift

Remove deprecated class PArpackSolver::Shift

Merge pull request #9841 from masterleinad/convert_loops

Use more range-based for loops.

Mention notebook in the original program

Add step-53 python