Link in step-44.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25108 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Deletion of old results in step-44

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25107 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Step-44: new images in results section

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25106 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

updated results

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25105 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

A number of minor changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25104 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

updated parameter file

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25103 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added the possibility to compute laplacians of a FEFieldFunction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25102 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New test for FEFieldFunction

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25101 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Added the possibility to compute laplacians of a FEFieldFunction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25100 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

changed definition of vol free energy to match standard

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25099 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

more small changes

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25098 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add another note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25095 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

some more small changes and references

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25094 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Merge Andrew's changes with mine.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25092 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Just minor edits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25091 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a link.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25090 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor doc update.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25088 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Since all png files are copied into the same directory, they need to have a unique prefix, for which we typically choose 'step-xx.'. Do so here. Also fix a typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25087 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25085 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

tut 44 near completion, final touches needed

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25083 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Reindent the whole file.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25082 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Formatting fixes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25081 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't use ExcNeedsUMFPACK but instead be explicit.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25080 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

new image for updated docs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25079 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated docs

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25078 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated source, seems to be working but needs checking

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25077 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for computing generalized eigenvalue problem with LAPACK added. Unlike full_matrix_05 this tests the more general function compute_generalized_eigenvalues_symmetric which allows specifying the accuracy up to which the generalized eigenvalues are computed and gives the option to set an interval in which eigenvalues are computed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25076 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

test for computing generalized eigenvalue problems with LAPACK added - this tests the simple version of compute_generalized_eigenvalues_symmetric

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25075 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Additional LAPACK routine for solving generalized eigenvalue problems added. The new function compute_generalized_eigenvalues_symmetric provides more functionality than then one with the same name already included in the library. In particular one can specify an interval where eigenvalues should be computed. Also one can provide the accuracy up to which eigenvalues are computed.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25073 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Write a nother paragraph.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25072 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Finish documenting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25071 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Markup improvements.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25070 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Qualify.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25069 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25068 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Don't output the residual any more. Next, move the force_residual
function into the only function that still uses it. Some more documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25067 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow IndexSet as a vector type in FEValues::get_function_values and friends; consequently, also allow it as the data type for DataOut::add_data_vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25066 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Update a completely outdated comment.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25065 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix operator return-type typo

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25064 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Move the DataEntryBase and derived classes out of the DataOut_DoFData class and into namespace internal. This is the first step to allowing completely different vector types for add_data_vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25063 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

fix documentation

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25061 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Link in step-41.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25060 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix typo.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25059 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Get rid of unneeded pictures. Write the results section.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25058 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resize.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25057 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Crop.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25056 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Resize.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25055 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Crop.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25054 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add more.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25053 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add output files.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25052 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify documentation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25051 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Unify the headers of the tutorial programs. Also remove the duplicate $Id:$ tags.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25050 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More minor changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25049 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Make clear that we are working on DoFs, not vertices.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25048 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25047 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more minor changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25046 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Yet some more reshuffling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25045 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some more reshuffling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25044 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Allow access to all vectors using both operator() and operator[] to make it simpler to write templates that also work with std::vector, for example.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25043 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New function IndexSet::fill_binary_vector.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25042 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

IndexSet::clear().

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25041 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Give Joerg more weight in the credits.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25040 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated source, still not converging

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25035 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Updated introduction for step-44

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25034 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Clarify text.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25032 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix up output files that were forgotten after Guido's patch in r24782 to slightly shift output done through logstream.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25029 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Timo fixed a bug in r24920. Fix the corresponding test results.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25028 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Fix a possible race condition introduced with revision 25023

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25027 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Create the lib/contrib/functionparser directory during build

    This commit adds a small hook, that creates the
    lib/contrib/functionparser directory during the build.

    This is particularly useful if the deal.II library is locally managed
    by a version control system that cannot track empty directories, such
    as git.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25024 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Bugfix: Create lib/debug and lib/optimized directories during build

This commit adds a small hook, that creates lib/debug and lib/optimized
directories during the build.

This is particularly useful if the deal.II library is locally managed
by a version control system that cannot track empty directories, such
as git.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25023 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Some steps to clean up the program.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25022 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor reshuffling.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25021 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Go over the text. Add a couple of pictures.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25020 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

New tests.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25019 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix Joerg's name.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25018 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a remark.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25017 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a remark.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25016 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Last efforts in cleaning up and documenting this program. There are
still a couple of places left, but by and large it's in good shape.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25015 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add l1_norm and linfty_norm for Tensor<2,dim>.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25014 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

VectorTools::interpolation_to_different_mesh implemented

VectorTools::interpolation_to_different_mesh gives the interpolation of a
dof1-function u1 to a dof2-function u2, where dof1 and dof2 represent
different triangulations with a common coarse grid.

dof1 and dof2 need to have the same finite element discretization.

The mapping between the two spaces is done via the help of the
InterGridMap<> class.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25013 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor reshuffling. Run it in 2d. Make sure that the time step is not
infinite because u*F' is zero.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25012 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Generate VTU output.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25011 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More shuffling and documenting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25009 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add forgotten instantiation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25008 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25007 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More reshuffling and documenting.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25006 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename f_saturation to fractional_flow.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25005 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add some explanation.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25004 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Minor formatting changes.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25003 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a bunch of things.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25002 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

More minor mods. Make the program more similar to step-31.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25001 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add one future direction.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@25000 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Document solve(), the central function of this program.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24997 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Rename a bunch of things. Minor cleanups.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24996 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Fix syntax.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24995 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Work around a problem on Bluegene systems.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24994 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Start working on this.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24990 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Check in Chih-Che's version.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24989 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add a note.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24987 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Add clarification

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24979 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d

Avoid use of \atop since that is deprecated with the amsmath package.

git-svn-id: https://svn.dealii.org/trunk@24978 0785d39b-7218-0410-832d-ea1e28bc413d