Merge pull request #16913 from drwells/tria-orientation-cleanup

Tria orientation cleanup

Merge pull request #16891 from bergbauer/active_q_points

FEPointEvaluation: Implement n_active_entries_per_quadrature_batch

Merge pull request #16909 from bangerth/matrix-free

Use slightly better variable names in the MatrixFree::loop() functions.

Merge pull request #16912 from kronbichler/mf_portable_minor

Portable tensor product kernels: Simplify loop

Use numbers::invalid_unsigned_int.

Split a long line.

Remove a double negative.

Clean up some long lines.

Merge pull request #16906 from bangerth/restriction

Explain the term 'restriction' in FiniteElement.

Portable tensor product kernels: Simplify loop

Polynomial: Make values_of_array always inline in release mode

Use slightly better variable names in the MatrixFree::loop() functions.

Explain the term 'restriction' in FiniteElement.

Merge pull request #16898 from bangerth/64

Fix use of incorrect Epetra function.

Merge pull request #16904 from bangerth/fix-anchor

Use the same style of anchor name as elsewhere.

Merge pull request #16899 from bangerth/message

Print a message on the screen when normalizing a test output.

Merge pull request #16903 from bangerth/href

When creating a reference, use 'href', not 'name'.

Merge pull request #16895 from kronbichler/fix_rpe

Small improvement to RemotePointEvaluation

When creating a reference, use 'href', not 'name'.

Use the same style of anchor name as elsewhere.

Merge pull request #16896 from kronbichler/fix_nonnested_transfer

Non-nested MG transfer: Avoid repeated access of arrays

Merge pull request #16902 from pcafrica/vector_traits

Add VectorTraits to Trilinos and Tpetra wrappers

Add VectorTraits to Trilinos and Tpetra wrappers

Non-nested MG transfer: Avoid repeated access of arrays

Small improvement to RemotePointEvaluation

Suppress some messages when normalizing test output.

Print a message on the screen when normalizing a test output.

Add a changelog entry.

Fix use of incorrect Epetra function.

Merge pull request #16887 from kinnewig/nedelec_sz_get_shape_value_component

Add get_shape_value_component() to FE_NedelecSZ

Add changelog entry.

Unify the different evaluate() functions into one templated function.

Merge pull request #16894 from marcfehling/sundials-7

Added changelog for #16879.

Added changelog for #16879.

Merge pull request #16621 from bangerth/boost-1.84

Import BOOST 1.84.

Merge pull request #16726 from RichardYCJ/master

Also change out_stream condition when enable/disable_output

Merge pull request #16880 from pcafrica/epetra_vector_access_operator

Epetra vector access operator

Merge pull request #16886 from kinnewig/nedelec_sz_prolongation_matrix

Add get_prolongation_matrix() to FE_NedelecSZ.

Add EpetraWrappers::VectorTraits class

Merge pull request #16889 from bangerth/doc-vector

Better document operator= for parallel vectors.

Add test

Implement n_active_entries_per_quadrature_batch

Write Doxygen entries for get_shape_value_component(), get_shape_grad_component() and get_shape_grad_grad_component().

Implement get_shape_value_component(), get_shape_grad_component() and get_shape_grad_grad_component().

Move the computation of the InternalData into a separate function.

Implement EpetraWrappers::internal::VectorReference

Minor cleanup

Add changelog entry.

Merge pull request #16879 from marcfehling/sundials-7

Compatibility with SUNDIALS 7.

Better document operator= for parallel vectors.

Testing the prolongation matrix of FE_NedelecSZ.

Add get_prolongation_matrix() to FE_NedelecSZ.

Merge pull request #16885 from quangx/step-32-typo

Fix typo regarding templates in step 32

Merge pull request #16884 from drwells/un-hardcode-2d-orientation

Un-hardcode 2d orientation.

change <2> to <dim>

Introduce get_communicator_by_value().

Move parentheses out of preprocessor conditionals.

Add a test.

This fails on master due to twisted elements.

FE_Q_Base: combine permutation operations.

FiniteElement: remove 2d orientation assumptions.

For mixed meshes, we need to support quadrilaterals whose faces may have either
valid line orientation.

FE_Q_Base: clean up an assertion.

FE_Q_Base: Simplify some code with 'if constexpr'.

Merge pull request #16854 from kronbichler/improve_mapping_info

 NonMatching::MappingInfo: Avoid memory allocations in reinit()

Merge pull request #16881 from marcfehling/tria_base-inst

Clean up many explicit instantiations.

Merge pull request #16883 from Rombur/python_binding_2

Add GridGenerator::cylinder/subdivided_cylinder/truncated_cone to the python wrappers

Merge pull request #16882 from masterleinad/fix_atomics_kokkos

Don't define __ATOMIC_* in bundled Kokkos

Merge pull request #16872 from drwells/mixed-mesh-orientation

Mixed mesh orientation

Don't define __ATOMIC_* in bundled Kokkos

Add changelog entry

Add GridGenerator::truncated_cone to the python wrappers

Add GridGenerator::subdivided_cylinder to the python wrappers

Add GridGenerator::cylinder to the python wrappers

Clean up many explicit instantiations.

Use alias for sundials booleantype.

Use correct types for sundials 7.

Merge pull request #15773 from luca-heltai/fe-coupling-values

FECouplingValues.

FECouplingValues.

Merge pull request #16876 from drwells/hdf5-floating-point-exceptions

Explicitly open HDF5 and then clear its floating-point exceptions.

More efficient access via new Mapping::InternalDataBase::reinit

NonMatching::MappingInfo: Avoid memory allocations in reinit()

Explicitly open HDF5 and then clear its floating-point exceptions.

New versions of HDF5 detect the floating-point environment by doing several
things which trigger floating point exceptions, i.e., programs in the test suite
now abort in H5open(). Work around that by explicitly setting up HDF5 before we
turn on the 'abort on floating point exceptions' code.

Merge pull request #16869 from peterrum/extract_level_constant_modes

Add DoFTools::extract_level_constant_modes()

Add a test.

Merge pull request #15572 from Rombur/init_finalize

Add InitFinalize base class of MPI_InitFinalize

Merge pull request #16875 from bangerth/typos

Fix a whole lot of typos.

Merge pull request #16870 from bangerth/distort-random

Update documentation for GridTools::distort_random().

Update documentation for GridTools::distort_random().

In particular also remove a reference to the function in the documentation of class
Triangulation. The function used to be part of that class, but has not been for a long
time.

Fix a whole lot of typos.

Merge pull request #16874 from bangerth/exc

Remove two exceptions that are apparently no longer used.

Remove two exceptions that are apparently no longer used.

Merge pull request #16871 from tjhei/maybe-uninit-orthogonal

fix maybe-unused warning in grid_tools_dofhandler

Merge pull request #16868 from masterleinad/remove_redundant_copy_assignment_vectorizedarrayiterator

Remove redundant defaulted copy assignment operator for VectorizedArrayIterator

execute_refinement_isotropic(): generalize line assignment.

execute_refinement_isotropic(): inherit orientations.

This fixes quadrilateral orientations on mixed meshes. A minor inconsistency in
this scheme is that the inner triangle faces must have different orientations on
different children.

execute_refinement_isotropic(): refactor.

TriaAccessor: permit calling set_combined_face_orientation() in 2d.

execute_refinement_isotropic(): Add a loop.

execute_refinement_isotropic(): Clean up some comments.

execute_refinement_isotropic(): Generalize 2d child line assignment.

Quadrilateral cells in mixed meshes may have lines with reversed orientations.
We can make that case work correctly by simply generalizing the code we already
have for triangles.

fix maybe-unused warning

```
./include/deal.II/grid/reference_cell.h:2799:22: warning:
‘face1_vertices.std::array<unsigned[763/12022] M_elems[0]’ may be used
uninitialized in this function [-Wmaybe-uninitialized]
./source/grid/grid_tools_dof_handlers.cc:2438:7: note:
‘face1_vertices.std::array<unsigned int, 1>::_M_elems[0]’ was declared
here
```